Önce 1. Fidan vakasından başlayalım. 1986'dan 2001'e kadar Türk Silahlı Kuvvetleri'nde astsubay olarak görev alan Hakan Fidan, 2003'te Başbakanlık Türk İşbirliği ve Kalkınma İdaresi Başkanlığı (TİKA) Başkanlığına atandı.
14 Kasım 2007'de Başbakanlık müsteşar yardımcılığına, 15 Nisan 2010'da Millî İstihbarat Teşkilatı (MİT) müsteşar yardımcılığına getirildi.
Emre Taner'in görev süresinin dolmasının ardından, 25 Mayıs 2010 tarihinde dönemin Başbakanı Recep Tayyip Erdoğan tarafından MİT Müsteşarı olarak atandı.
Türkiye Cumhuriyeti devletinde, "Astsubay kökenli, en genç MİT müsteşarı" olarak ilklere imza attı.